ну да, почему бы из репов не поставить?
и пусть оно обновляется при обновлении системы
и подкрутите пожалуйста что б автоматически правился конфиг
который, кстати, я вчера так и не нашёл, сам pma устанавливается в /var/www/phpmyadmin это я в скрипте установки подсмотрел, но в этой папке нашёл только "исходник" конфига
а вот по поводу "Хранилище конфигурации phpMyAdmin не полностью настроено" честно говоря не знаю как, не вникал
при установке скриптами (ранее о них упоминал, в теме про убунту 6 которые) эта "настройка" делается аутоматишно (вчера крутил те скрипты, подправил маленько "под себя", но не видел где запускается этот процесс "тюнинга", вполне возможно он "встроен" в установщик
смысл этого "тюнинга" в том, что надо сформировать ещё одну базу и какие то настройки будут храниться в этой базе
по этому тюнингу надо погуглить
UPD
да собственно долго гуглить то и не пришлось
вспомнил, по "опыту" использования VestaCP - есть готовые "патчи" под разные ОСи
https://forum.vestacp.com/viewtopic.php ... 2c3b2cfab4
возможно пригодится
PS
ну и наверное стоит установку phpmyadmin сделать куда то по "стандартному" пути
в /etc/phpmyadmin/ или /usr/share/phpmyadmin/